Die Kooperation mit öffentlichen Schulen ist der Musikschule Herbrechtingen ein besonderes Anliegen, denn Musik ist vor allem in der Entwicklung junger Menschen ein prägendes Element. Die Musikschule unterstützt daher die Kulturinitiative „Jedem Kind ein Instrument“ (JeKi) und setzt sie an der Grund- und Werkrealschule Bibris und an der Grundschule Bissingen um. Dies ist ab Herbst 2010 auch am Buigen-Gymnasium geplant. JeKi gibt jedem Kind die Möglichkeit, ein Instrument zu lernen. Ein weiteres Beispiel für eine Kooperation mit einer öffentlichen Schule sind die Musiktheaterstücke, die die Musikschule regelmäßig in Zusammenarbeit mit allgemeinbildenden Schulen aufführt.